Отец Сусуму строил подлодку в обстановке полной секретности, а сам Сусуму крутил гайки в машинном отсеке и особо не задавал вопросов. Пока однажды не выяснилось, что за штурвалом «Супер 99» ему придётся стоять самому. Не потому что кто-то приказал свыше, а потому что выбора попросту не осталось.

Дальше начинается странное. Вражеские субмарины будто знают маршрут наперёд, а среди своих находится тот, кто сливает координаты. Каждая стычка с флотом Империи оборачивается не победой, а новой трещиной в корпусе и в отношениях между людьми. Сусуму приходится чинить механизмы, которые валятся от перегрузок, и разгребать чужие ошибки, за которые почему-то отвечает он.

А главная засада в том, что Империя не однородна. Там тоже есть люди со своими причинами топить чужие корабли. И чем ближе «Супер 99» подбирается к центру конфликта, тем меньше в этой войне остаётся правых. Кто отдаёт приказы с той стороны и почему экипаж лодки вдруг стал разменной монетой в чужой игре?